磷酸燃料电池被称为代燃料电池，简称PAFC，其使用之电解质为100浓度之磷酸，具有发电效率高、清洁、无噪音等优点，是当前商业化发展得最快的一种燃料电池。既可用于大规模发电，也可作为医院或居民区供电、汽车动力电池以及不间断电源等。
磷酸燃料电池（Phosphoric Acid Fuel Cell, PAFC）是以浓磷酸为电解质，以贵金属催化的气体扩散电极为正、负电极的中温型燃料电池。可以在150～220℃工作。具有电解质稳定、磷酸可浓缩、水蒸气压低和阳极催化剂不易被CO毒化等优点，是一种接近商品化的民用燃料电池。
磷酸燃料电池的基本组成和反应原理是：燃料气体或城市煤气添加水蒸气后送到改质器，把燃料转化成H2、CO和水蒸气的混合物，CO和水进一步在移位反应器中经触媒剂转化成H2和CO2。经过如此处理后的燃料气体进入燃料堆的负极（燃料极），同时将氧输送到燃料堆的正极（空气极）进行化学反应，借助触媒剂的作用迅速产生电能和热能。
阳极反应：H2+2e- →2H+
阴极反应：1/2O2+2H+ → H2O+2e-
总反应： 1/2O2 +H2 → H2O
磷酸燃料电池作为一种中低温型（工作温度180-210℃）燃料电池，不但具有发电效率高、清洁、适应多样燃料、无噪音、运转费低、设置场所限制少、大气压运转容易操作、安全性优良、部分负荷特性好等特点，而且还可以热水形式回收大部分热量。最初开发磷酸燃料电池是为了控制发电厂的峰谷用电平衡，近来则侧重于作为向公寓、购物中心、医院、宾馆等地方提供电和热的现场集中电力系统。
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