PCR的不足
普通的PCR有一定的不足之处,如难以实现多重扩增以及在PCR过程中存在竞争等.Mosaic Technologies公司的研究人员研究出了固相PCR系统,他们将两个引物固化在丙烯酰胺薄膜上,并让其与DNA模板和PCR试剂接触,这样便可在固相表面进行PCR反应。扩增时所合成的DNA会在引物间形成桥,从而避免了竞争问题.该系统还处于研究阶段。在核酸样品制备中另一个革新的方法是Lynx Therapeutics公司研究的大规模并行固相克隆,该方法可以同时在样品中克隆出成百上千个单独的DNA片段.
检测方法
常用的芯片检测方法有芯片毛细管电泳分离检测和亲和结合分析。芯片毛细管电泳是1983年由Dupont公司的Pace开发出来的.随后,瑞士的Ciba Geigy公司和加拿大的Alberta大学合作利用玻璃芯片毛细管电泳完成了对寡核苷酸的分离[27].首次用芯片毛细管阵列电泳检测DNA突变和对DNA进行测序工作的是由加利福尼亚大学伯克利分校Mathies领导的研究小组完成的[28].通过在芯片上加上高压直流电,他们在近2 min的时间内便完成了从118~1 353 bp的多条DNA片段的快速分离。宾夕法尼亚大学Wilding的小组与Ramsey的小组一道用芯片毛细管电泳对芯片中通过多重扩增得到的用于Duchenne-Becker肌萎缩诊断的若干DNA片段进行分离也获得了成功[29].其他用芯片毛细管电泳检测突变的外国公司和学术机构有Perkin-Elmer公司、Caliper Technologies公司、Aclara Biosciences公司和麻省理工学院等。