PWM定时器的计数缓冲寄存器TCNTBn的值是当定时器使能时装载到减法计数器上的初始值，定时器比较缓冲寄存器TCMPBn的值，将装载到比较寄存器并与减法计数器的值比较。TCNTBn和TCMPBn双重缓冲的特性使定时器在频率和占空比改变时，也能产生稳定的输出。
每个计数器都有自己的16位减法计数器，由定时器时钟驱动。当定时器计数器达到0时，定时器发出中断请求，通知处理器定时结束。对应的TCNTBn将自动载入计数器，从而可进入下一个操作。如果定时器己经停止，再清除TCONn中的定时器使能位，则TCNTBn中的值将不会被载入到计数器中。
TCMPBn的值用于脉宽调制，当该计数器值与定时器控制逻辑中的比较寄存器值相等时，定时器控制逻辑改变输出电平。因此，比较寄存器决定PWM输出的高电平时间（或者低电平时间）。
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